六世班禅巴丹益喜圆寂以后，共找了四个转世灵童。扎什伦布寺派出六世班禅的苏本堪布前往四个“灵童”的家属进行明察暗访，并拿出六世班禅生前用过的茶杯、铃杵、念珠等，让“灵童”自己挑选，以行试验。据说只有白朗宗吉雄溪卡的“灵童”选出的器物，都是六世班禅用过的。于是苏本堪布首先肯定这个“灵童”确系六世班禅的“转世”。于是扎寺即请驻藏大臣博清额转奏清高宗予以批准。1782年，清高宗批准了奏请。七世班禅完成了认定手续。

1784年，“灵童”被迎到扎什伦布寺，八月十二日在扎寺日光殿上举行了七世班禅坐床大典，由驻藏大臣博清额亲自主持。九月初七日，在扎什伦布寺的益格穹曾宫内，举行了八世达赖给七世班禅剪发并取法名的典礼，取法名为吉总罗桑巴丹丹白尼玛确来南加贝桑布，简称丹白尼玛。接着，又授近事戒。清乾隆五十四年（1789)六月四日，由八世达赖授给沙弥戒。1801年（清嘉庆六年）七世班禅丹白尼玛十九岁，由八世达赖授比丘戒。

七世班禅自坐床以来，是清朝中央政权对西藏地方的统治达到了它的全盛时期，《钦定二十九条章程》和西藏重大政治制度与宗教制度，都是在这一时期制定的。但是，西藏地方开始遭到外国势力的侵略，廓尔喀人两次攻入西藏，把扎什伦布寺抢掠一空，幸亏当时清朝政府及时派兵入藏，将侵入西藏的廓尔喀人全部驱逐出境。在廓尔喀人入侵时，扎什伦布寺本身不仅遭到重大破坏，扎寺所属百姓，更遭到敌人的残酷蹂躏。由于七世班禅的辛勤工作，领导有方，再加上国家的大力支援，到七世班禅晚年时，扎寺及所属百姓，基本上恢复到灾前的水平。这些都应说是七世班禅的贡献。七世班禅一生经历了清高宗、清仁宗、清宣宗和清文宗四个皇帝的统治，和他共事的驻藏大臣前后有37人，帮办大臣有39人（其中有些帮办大臣后来升任办事大臣）。七世班禅始终坚定地站在承认西藏是中国领土的不可分割的一部分的立场，站在西藏地方属于清朝中央的立场，对于历代皇帝都是非常恭顺的，对历任驻藏大臣都是很尊重的，凡是扎寺的大事，都通过驻藏大臣请示皇帝批准；清朝皇帝要他办的事情，他都是尽心尽力办理。所以历代皇帝与历任驻藏大臣对七世班禅都是很信任的。这是七世班禅在维护祖国统一与民族团结方面的重大贡献。另外，七世班禅是八世达赖的徒弟，他又是九、十、十一世达赖的师傅，他和这几代达赖的关系都是很好的。他很注意搞好与达赖集团的关系。例如，在清道光二十四年，清宣宗令他为西藏摄政，起初他不愿担任，后因不能违抗“圣旨”，而勉强担任了八个月摄政，以后坚决辞去。这种明智的态度，对巩固西藏内部的团结作出了贡献。